是日本文部科学省（相当于国内教育部）直属的大学，在日本有八十多所。一般在研究领域数一数二的大学，基本上都是出自于国立大学。而且还有很多出名的学群，比如：【东京一工】：东京大学，京都大学，一桥大学，东京工业大学；【日本7所旧帝大】：北海道大学，东北大学，东京大学，名古屋大学，京都大学，大阪大学，九州大学。
是由各地方政府出资运营的大学，在日本有九十多所。比如：都立大学；大阪市立大学；以及其他各地的县立，市立大学等。
相较于私立大学，日本国公立大学的学费统一且更低廉一些。
是由学校法人或财团等创办的大学。在日本有上百所，占日本大学数量的七成以上。由于私立大学数量多，所以层次参差不齐，比如：早庆上理ICU（早稻田大学，庆应义塾大学，上智大学，东京理科大学，国际基督教大学）；G-MARCH（学习院大学，明治大学，中央大学，立教大学，中央大学，法政大学）等牛校；也有像日本经济大学这样相当普通的学校，学校实力良莠不齐。
这一类学校相当于大专，2-3年学制，颁发专科毕业证书，无学位。毕业后可大三编入学部（专升本）。日本专门学校主要以职业教育为培养目标，更注重培养学生生活能力和就职能力，简而言之，就是掌握一门技艺。因此未来打算在日本就业的同学可以考虑就读日本专门学校。
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